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宋河顺手开了一个新程序,按伊雷马实验室数据,同步复现药物预测流程。

别人做的成果,他不敢全盘接收,还是亲自上手验证一下稳妥!

首先是经典的ddIs预测,即药物-药物相互作用,探讨病人短时间服用多种药物后,产生的复合效应。

当初在京海大学实验室,吕承恩讲过中药预测五原则,相反为制、相畏为制、相喜为制、相资为制、相恶为制,也是药物和药物相互作用的原理,只不过现代的ddIs预测深入到分子层面了。

之前宋河看相关论文时,见过基于图卷积神经网络的ddIs预测,以及基于平衡理论的预测。

前者太片面,只考虑邻接矩阵元素。而后者则太绝对,总结起来就是“朋友的朋友是朋友”、“朋友的朋友是敌人”,但实际的药物研发中,关系远比平衡理论要错综复杂。

电脑屏幕上,伊雷马实验室居然两种方法都弃之不用,赫然使用了新方法进行ddIs预测!

宋河研读许久,基本明白了思路……大数据库推导!

伊雷马实验室尝试将海量化合物进行拓展,梳理出亲戚关系,画出一个壮观的树状图,每个枝丫都连接一种相似的化合物。

之后,再通过已经确定的化合物药用特性,大胆猜测未知化合物的药效。

这感觉好比,知道丈夫是生物学家,知道妻子是短跑运动员,于是便猜测这对夫妻将来的孙子能够……一边短跑冲刺一边手拿显微镜观察细菌……

本质上还是瞎猜药物,但在瞎猜中多了一丝丝牵强附会的推理。

“好难!”宋河吐槽。

他在帖子里寻找伊雷马实验室用的大数据库。

找了半天……没找到?

“怪不得呢!原来公布的只是边缘数据,最核心的没公布啊!”宋河摇头失笑。

没办法,他只得尝试自己搜集数据库。

他先在网上寻找,用过相似工作方式的科研团队。

花了许久,总共找到两个。

一个是千度公司合作的研发团队,通过大量食管癌病人的数据,寻找到22个显着突变基因,随后预测关联出可行的药物信息。

一个是mSK癌症中心,开发了一个体细胞突变相关的知识库,收录了大量靶向药。

“都是做癌症的数据库,用不上啊!”宋河挠头。

思前想后,他掏出手机,找相晓桐老师场外求助。

“老师,我需要一个安眠药相关的大数据库,做药物预测用,您知道从哪能弄到吗?学生万谢!”

刚发消息,宋河马上后悔,大半夜的,会不会打扰老师休息?

没想到过了几秒,回复便来了。

相晓桐:“我知道谭西教授的团队自建了一个安眠药数据库,但谭西那人小心眼,断不可能提供给你。”

相晓桐:“这样吧,我团队里有黑客,帮你上网抓一些相关数据下来,能抓多少不确定,你做个参考。”

宋河连忙回复,“谢谢老师!学生简直不知道该怎么感谢您好了!”

相晓桐:“回头跟着我学脑的时候,好好干活就行。”

一小时后,相晓桐一股脑扔来大堆数据文件。

宋河打开看,每一份文件均为庞然大物!

海量的数据,杂乱不堪,有他想要的化合物分析,有奇奇怪怪的废数据,大部分来自世界各地医药组织的数据库,千奇百怪的语言齐聚一堂,光是机翻都要很久。

如果自己单独干,仅仅梳理完这些数据,恐怕都得拖到过年!

宋河幽幽长叹一声,看来这次做短眠药,必须雇佣实验团队了!

和军用的环形山炸药不同,短眠药这东西主要是商业价值,无需过于水泄不通的保密措施,招些可靠的人手来干活,注意分工即可。

宋河在反间谍教材上,学过一种行之有效的保密方法,盲人摸象法。

大型项目常用这种方法,将工作人员分小组,每组只负责一小部分操作,各小组之间严禁互通消息。

如此一来,所有置身事内的人,只能了解自己眼前的一小部分,无法得知整个项目的全貌,哪怕有个别间谍混入,窃取的消息也远不足以损害全局,甚至会得到误导性的信息。

有点像军舰里的水密隔舱,众多互不相通的舱室,即使其中一两个舱室被鱼类击中进水,其他舱室完好无损,依旧能保持舰体不沉。

计划很美好。

可是,人手去哪雇佣?

……

航天镇,总务楼三楼。

1号办事处。

宋河孤零零坐在桌边,手指头匀速敲打桌子等待。

房间门突然打开,穿洁白羽绒服的唐蓉蓉出现,脸色困倦,“帅哥,非要大半夜办业务吗?”

“有劳。”宋河把一张紫色证件递过去。

唐蓉蓉困意消失了一半,“你升2级了?这么快!办什么业务?”

“我要开课。”宋河说,“手里没有申请表,你给我一张,我现在填。”

唐蓉蓉动作迅速,拉开办公桌抽屉,翻出一张申请表递过去,又奉上一支中性笔。

宋河刷刷填写,将整张表从头到尾填满。

【新开课程名称:药物研发分析】

【学生上限:80人】

【对学生的要求:数学能力过硬,有生物知识者优先】

【课时:每天上午前两节,共7天】

【主讲教师信息:宋河,2级项目带头人,宋河素发明人】

【申报课程原因:选拔一批对药物感兴趣且资质优异的人才,进行培训后加入短眠药开发团队】

【课程主讲内容:药物预测及新药开发】

又填了一大堆琐碎的信息,宋河将申请表推给唐蓉蓉。

“好!”唐蓉蓉在屏幕上输入,“已经报上去了,大概天亮会出审批结果,一是确定你这门课程能不能开,二是确定授权给你多少积分。”

“我讲课的积分吗?”宋河问。

“一方面是你讲课的积分,一方面是读你课程的学生,结课后学生们能拿多少分。”

宋河点头,积分很重要。

定选已进入白热化阶段,所有人眼冒绿光地四处刷分,一门课程值多少分,成了最关键的选课标准!

尤其是和其他开课的学术泰斗相比,宋河很清楚自己人微言轻,如果课程分不够高,说不定开课后门可罗雀,压根选不出合格的实验团队。

一步错步步错,万一选不到足够的人手,对于短眠药的研发进度将是致命的!

“我提醒一下,你得做好心理准备!”唐蓉蓉道。

“此话怎讲?”宋河微微皱眉,“你感觉我申报的课程批不下来?”

唐蓉蓉拉开抽屉,拿出另一张申报表,摆在桌上。

宋河扫了一眼,眉头瞬间皱紧。

内部竞争对手,谭西教授的新课申请表!

授课方向赫然是“药物综合”,明显他也在招兵买马扩充团队!

“这张表是几小时前谭西教授送来的,不出意外的话,你们俩申请的课程会同时审批。”唐蓉蓉说,“他可是3级项目带头人,你只有2级!”

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