有这个想法的并不止柯南一个，对这座图书馆的秘密和传说中的哲人石感到好奇的安室透也决定晚上出击。
就这样，一大一小趁着其他人在旅馆入睡后，一前一后地进入了阿佐特图书馆。柯南甚至还感慨了一下老看守居然没有给图书馆的大门上锁。
由于这两人调查的方向并不相同，所以柯南一进图书馆是直奔着大厅的那些书柜而去的，他认为这些书柜之中最有可能藏着暗道。安室透则是回到了早上去过的残月馆长的办公室，试图再找出一些线索。
大厅内，柯南掏出手表手电筒，照着那一排排的书架。不过从表面上看完全看不出什么端倪，柯南只好从书架中抽出了几本书翻看，随后他的大脑就被晦涩难懂的炼金知识袭击了。
“真是的，这些炼金术可不光是化学知识啊，天文占卜之类的也被糅合在里面了吧。”柯南揉了揉自己的太阳穴抱怨着。
突然，他注意到被抽出的其中一本书看起来是一本日记，好奇之下，他开始翻阅这本日记。
这本日记的主人似乎是阿佐特图书馆的一位管家小姐。
“今天是我入职阿佐特图书馆的第一天！老看守带着我走过了那座老旧的吊桥，图书馆的现任馆长是墨丘利馆长，他是位宽和的老人，是密教的元老，一位知识渊博的炼金大师。”
“墨丘利馆长带着自己的女儿来图书馆了，米勒小姐不愧是四骑士家族的后人，虽然目不能视，却拥有常人所不能及的感官。我听老看守说米勒小姐的通感能力非常强，她甚至能靠触摸那些纸张和文字就感知到其中蕴含的知识。”
“怎么会这样？老看守说米勒小姐放出了图书馆的诅咒？墨丘利馆长难辞其咎，他自断了无名指辞去了馆长的职务，米勒小姐也离开了......哦，玛利亚女士保佑，我什么都不知道，诅咒千万不要找上我！”
看到这，柯南心中了然，前一任馆长艾莉亚·米勒女士和图书馆的“诅咒”一定有相当大的关联，很可能她就是欧利蒂丝组织的研究人员，在发现了什么秘密后试图逃离。
柯南翻开了日记的下一页。
“墨丘利馆长推荐继任的馆长是玛尔斯先生，一位在矿难中大难不死的年轻人。玛尔斯馆长有着一本古老的典籍，他称这是他的‘机遇’。自从玛尔斯馆长掌管了阿佐特图书馆，他就一直执着于炼制出传说中的‘至纯之水’。”
“老看守说‘至纯之水’可以点石成金，将贫金属转化为贵金属，甚至可以成为炼制哲人石的原料。老天呀，玛利亚女士保佑，和哲人石沾上边一定不会有好事发生的......”
“出事了，果然出事了，我看到玛尔斯馆长倒在自己的办公室里，脸色苍白，还不停咳嗽，尽管他声称这只是炼金过程中微不足道的代价，但他的状态看起来真的很不好！我在离开办公室的时候撞倒了几个试剂瓶，里面装着的似乎是各种各样的矿石，我拿去给老看守看了一下，他却让我赶快丢掉，因为那些是拥有剧毒的辉锑矿。”
柯南皱了皱眉头，他对辉锑矿有印象，之前愚人金在天空船上和他说过他的身体就是辉锑矿组成的。
“所以，愚人金就是玛尔斯馆长吗？那他是怎么变成那个样子的，是炼金术出了意外，还是有意为之？”
这样想着，柯南再次翻过了一页纸。
“玛尔斯馆长失踪了，就在他的办公室里！炼金的坩埚里还残留着实验的产物，地上洒满了辉锑矿的碎片，而不少珍贵的矿石都不见了！警察前来调查，却什么有用线索都没有找到，只有玛尔斯馆长的炼金笔记还留在桌上，封面上有一个用鲜血绘制的倒三角形符号。”
“又过了好几天，警方始终都没有找到玛尔斯馆长，他们认为这是一场入室盗窃案，玛尔斯馆长一定是被强盗绑走后遇害了。老看守很气愤，他认为这绝对不可能，他认为玛尔斯馆长一定是在实验过程中遇害的，因为前几天玛尔斯馆长才和他说过会对‘至纯之水’进行最后的调试。”
“这太奇怪了，这才过了几天，我就在整理书架的时候发现，玛尔斯馆长以前的一些手稿都不见了，一定是有人觊觎玛尔斯馆长的炼金成果才动手杀了他，还隐藏了尸体！这太可怕了，玛利亚女士保佑，这样的祸事不要发生在我身上......”
柯南结合这一段日记的内容，倒是推理出了另外的结果：“玛尔斯馆长应该是在炼制‘至纯之水’的时候出了问题，把自己变成了一个由矿石组成的人的样子，也许是背后的欧利蒂丝组织为了隐瞒这一切才做出了入室盗窃的假象。”
柯南接着翻动日记。
“玛尔斯馆长推荐的下一任馆长是斐乐蒙先生，他出身于四骑士家族，彬彬有礼，对于炼制哲人石的挑战信心满满，可我却隐隐有些担忧，上一任馆长的事件余温尚在，新任的馆长就又和哲人石扯上关系了。玛利亚女士保佑.......”
柯南挠了挠头：“看来这几位出事的馆长应该都和哲人石的研究脱不了关系。”
日记上的内容还在继续。
“斐乐蒙馆长决定从‘至纯之气’入手，炼制一个‘完美的人类’来作为哲人石的原料。他展开了那份祖传的画作给我和老看守看，并认为只要能提炼出‘至纯之气’，炼制哲人石将触手可及。”
“斐乐蒙馆长真的成功了！我和老看守都为他感到高兴，那尊小小的人形漂浮在烧瓶内，斐乐蒙馆长将他命名为‘何蒙库鲁兹’，是拉丁语中‘小人’的意思。”
柯南大吃一惊：“这已经是人体实验的范畴了吧，还真是让人吃惊啊。”
不过知晓几位馆长结局的柯南认为实验恐怕没那么顺利，于是接着翻了下去。
“实验似乎失败了？斐乐蒙馆长相当颓废，他说‘何蒙库鲁兹’已经完全成型了，可是却无知无觉，甚至不能说话，更不能用说拿来炼制哲人石了。我趁馆长不注意偷偷看了看那个小人，那小人却突然睁开一只眼睛看了我一下，我被吓到了，连忙把这个消息告诉了馆长，可斐乐蒙馆长认为我只是在安慰他，并没有特别在意。”
“虽然‘何蒙库鲁兹’并不能达成实验目的，但斐乐蒙馆长还是决定悉心培养他，那小人被转移到了一个更大的烧瓶内，开始慢慢长大了，看起来还有点可爱。我也在心里松了一口气，没有哲人石，没有诅咒，真是玛利亚女士保佑啊。”