无比繁杂的事业，让时间飞快，很快就是新的一年，也就是同治元年，1862年。
英法的使臣依然在上海与清廷扯皮，双方都在拖延时间，英法想将一些有爵位的，有背景的军官先赎回去，但是清廷不干，要么一笔买卖，要么不谈，价格慢慢降低，但是拖起来慢慢降价。
半年的时间拖了过去，清廷现在不觉得养这些俘虏划不来了，因为这些俘虏在维修军舰、协助练兵上非常有效果。英法籍的俘虏军官和士兵看到这么长时间都没被赎，也不敢倨傲，为了一口饱饭和不挨打，还是该干活了。
蓝图绘制好，就需要时间来落实。惠农公司已经初步显现作用，广东一带亚热带地区的农业生产效率已经得到提高，农民开始增收，到今年收获季可以还上赊欠的农具、种子和肥料钱。增收的粮食，广东官府收购了一半，“丰南号”收购了一半，都得点好处。
官府需要粮食填补江南地带被太平军占领导致的粮食缺额，“丰南号”则需要额外支援吕宋岛的石达开部。
福州和泉州的船厂已经开始边建设边生产，“丰南号”已经开设多个船厂，这方面有足够的经验，一套熟练的班组过去，就能带动。
蒸汽机则由“丰南号”提供，目前清廷境内还没有能力生产。此时，有眼力的商人开始瞄准了小煤窑和桐油这些造船业的产业链，甚至开设了水手培训的学校，提前开始介入。这就是民营经济的活力，一旦给予一点春风，就像野草一样钻了出来。
东北天寒地冻，就等着开春，煤矿已经可以开采，将陆续向抚顺和大连运输，再有一部分通过航运到天津，用于蒸汽机船的使用。
一旦经济有了活水注入，就像树木的呼吸作用一样，从根部开始滋养，渐渐推动外贸行业的兴起，农民有了点钱，或许一户人家多置办一件新衣服或者一套被褥，加起来就多了。
这种动静会反馈到香港和澳门的进出口商贸，欧洲商人就会很快发现这种变化，就会牵动洋布的贸易，然后商船到了中国不可能空船回去，自然是要捎带中国的货物回欧洲，或者贩卖到美洲去。
如果没有战争的威胁，这种发展在五六年时间里，中国会渐渐富裕起来，“丰南号”会更加富裕，装备会更加先进。但是，战争不会给这么长时间让你蓬勃发展。
所以，沈云峰决定出手赶另外一只“鸭子”上架，解决内患问题，好集中资源对抗外部侵略。
此时，曾国藩已经攻下安庆城，与张树声领导的淮军一起将太平军的李秀成部主力压缩在江南皖浙和江苏一带。陈玉成部和捻军围困在江北一带。
过了年，沈云峰约奕欣到达上海，合力解决太平军的问题。曾国藩和张树声被召至上海，接受指令。
由曾国藩部在浙江杭州湖州一带压缩李秀成部，张树声部在苏州、常州一带压缩，然后，北洋水师第一次接受调遣，蒸汽机舰船驶入扬子江，会同张树声部进攻天京，两日内攻陷天京城，斩洪秀全等人。
正在浙江的李秀成和江北的陈玉成均无法突围回防支援天京，太平军彻底失去精神领袖。
曾国藩欲乘威攻破李秀成部，报其弟曾国华在三河之战中战死之仇。沈云峰乘船至南京，召见曾国藩，曾国藩上船后，下船后面色如土，不敢造次。继续对李秀成部围而不攻，渐渐压缩李秀成部至浙东及苏州南部一带。
在宁波驻扎的李世贤从海上接到沈云峰给李秀成的信件，星夜送往正在杭州的李秀成。李秀成看完信之后，纠结了两天，率兵退出杭州向宁波、台州、温州一带退去。
曾国藩部压着李秀成的退兵向前压进防线，直到李秀成部退到绍兴、金华、丽水一带。
留下部分兵力布防之后，曾国藩分出兵力开始北上，对江北的陈玉成部加大合围之势。
此时，正在合肥一带的太平军陈玉成接到清军通告，并转送李秀成书信和沈云峰书信，要求半个月内将军队从芜湖过江，向台州方向转移。
部分捻军也接到通告。通报下达之后，太平军陈玉成部和捻军各部反应不一。但此时，太平军已经失去了精神领袖洪秀全，属于群龙无首之情况。
陈玉成最终审时度势，从清军让出的通道前往台州，与李玉成部会合。
而捻军则四分五裂，有的追随了陈玉成南下，有的则继续和清军作战，固化地盘，收拢各部。
至五月初，太平军初定，曾国藩召唤其弟曾国荃在杭州见面商议。
兄弟两人让左右退下，单独聊天。
曾国藩长叹一声：“狡兔尽，良弓藏。”
曾国荃不明就里，便问：“朝廷难道已经有了安排了？”
曾国藩点点头说：“我出任两江总督，兼顾弹压太平军余孽，你北上陕甘，出任新军都统。”
曾国荃感觉还行，也算不上那么悲观，叹气说：“只恨不能清剿太平军余孽，杀了李玉成这厮，为国华报仇。那日，沈匪与兄长说了什么，让兄长放弃。”
曾国藩摇头说：“以后切勿叫沈匪。我若不听从镇南王的安排，我们兄弟估计难以全身而退，他已经做好准备了。”
曾国荃恨恨的说：“这厮，太可恨。他究竟要太平匪作甚！”
曾国藩小声说：“让太平匪先防范海边，防止英法联军的报复，未来让他们出海。”
曾国荃惊坐，半天才出声：“这厮所谋甚大。”
曾国藩点点头说：“是的，你我兄弟格局不如镇南王。他告诫我一句，既然出世，当观世界，为天下计，才不负此生。”
“此人不在乎你我性命，也不在乎大清的江山社稷，他在乎的是洋人，挡在他前面的，他必然除去，所以，你不要惹他。”曾国藩再次点醒自己的弟弟。
半月之后，张树声率淮军北上，策援僧格林沁清扫北方的捻军。曾国荃率五千湘军入陕任都统。
胡林翼旗下满人大将多隆阿奉调黑龙江任新军都统，与左宗棠一道归于黑龙江将军特普钦麾下。
至此，国内大局已初定。