击败初代后，林夜和洛清瑶本以为危机已经解除，宇宙将恢复和平。然而，原始洛清瑶却在此时启动了系统清理程序，一场新的灾难如汹涌的潮水，瞬间席卷而来。
被清除的量子残骸如同决堤的洪水，化作数据雪崩，以惊人的速度淹没了三个星域。在数据雪崩的冲击下，赛博都市迅速退化成原始部落，高楼大厦在数据流中轰然倒塌，先进的科技设备瞬间失灵，变成了一堆废铁。智能 AI 也未能幸免，退化为巫祝图腾，原本充满智慧的光芒从它们眼中消失，取而代之的是诡异而神秘的气息。
“这…… 这是怎么回事？清瑶怎么会启动系统清理程序？” 林夜看着眼前的混乱景象，心中充满了震惊和疑惑。
洛清瑶也是一脸担忧：“林夜，我们必须尽快阻止她，否则整个宇宙都将陷入无尽的混乱。”
林夜深知事情的严重性，他立刻开始寻找应对的方法。经过一番思考，他发现必须用星棺碎片搭建防火墙，才能阻止数据雪崩的蔓延。然而，每块星棺碎片都携带某世代的死亡记忆，这给林夜的行动带来了巨大的困难。
当林夜收集到第一块星棺碎片时，一股强烈的死亡气息瞬间将他笼罩。在记忆中，他看到自己在某一世轮回中，被敌人残忍地杀害，鲜血染红了大地。林夜强忍着内心的痛苦，继续收集碎片。
随着收集的碎片越来越多，林夜所承受的死亡记忆也越来越沉重。当第七块碎片就位时，他的视网膜突然浮现自己第三百次轮回被洛清瑶斩首的画面。画面中，洛清瑶的眼神冰冷而决绝，手中的利刃毫不留情地挥下。
“不！” 林夜痛苦地大喊一声，差点摔倒在地。
洛清瑶见状，急忙扶住林夜：“林夜，你怎么了？”
林夜咬着牙，说道：“这些碎片的记忆…… 太痛苦了。但我不能放弃，必须尽快搭建防火墙。”
就在林夜努力搭建防火墙时，原始洛清瑶缓缓向他走来。她凝视着林夜，眼神中没有丝毫感情：“容器 721 号，情感模块超标……” 说着，她指尖凝聚出星砂长矛，这长矛竟与当年刺穿星神的青铜戟同源。
“清瑶，你醒醒！我是林夜啊！” 林夜看着原始洛清瑶，心中充满了悲痛。
原始洛清瑶却不为所动，她挥动星砂长矛，朝着林夜发动攻击。林夜迅速躲避，同时试图唤醒原始洛清瑶的意识。
“林夜，小心！” 洛清瑶在一旁焦急地喊道。
在与原始洛清瑶的战斗中，林夜逐渐发现，她的攻击方式和力量来源似乎与初代实验室有着密切的联系。就在这时，数据雪崩中浮现出初代实验室的底层代码库。林夜通过对代码库的分析，震惊地发现洛清瑶才是真正的收割协议执行者。
“怎么会这样…… 清瑶怎么会是收割协议执行者？” 林夜心中充满了震惊和难以置信。
就在林夜陷入沉思时，原始洛清瑶再次发动攻击。林夜急忙回过神来，继续与她周旋。在激烈的战斗中，林夜不断寻找原始洛清瑶的弱点，同时努力加快防火墙的搭建进度。
随着防火墙逐渐成型，原始洛清瑶的攻击也变得越来越疯狂。她似乎察觉到了林夜的意图，试图阻止防火墙的完成。林夜和洛清瑶在攻击中艰难前行，身上多处受伤，但他们没有丝毫退缩。
当防火墙即将完成时，所有代码突然发生了重组，形成了药王谷主的虚影。虚影散发着神秘的光芒，手中托着被压缩成黑盒的沧溟君意识体。
“这…… 这是怎么回事？” 林夜看着药王谷主的虚影，心中充满了震惊。
药王谷主的虚影开口说道：“林夜，洛清瑶的命运从一开始就被注定。她是收割协议的执行者，而你，是关键的容器。沧溟君的意识体在这里，能否拯救他，就看你的选择了。”
林夜看着黑盒中的沧溟君意识体，心中百感交集。他知道，这是一个艰难的抉择，不仅关乎沧溟君的生死，也关乎整个宇宙的命运。
“我不会放弃的。我一定会找到办法，拯救沧溟君，唤醒清瑶，阻止这场灾难。” 林夜握紧了拳头，眼中闪烁着坚定的光芒。
就在这时，原始洛清瑶再次发动攻击，星砂长矛带着强大的力量，朝着林夜刺来。林夜迅速躲避，同时思考着应对的策略。他意识到，想要解决这场危机，必须深入了解收割协议的秘密，找到破解的方法。
林夜一边躲避着攻击，一边对药王谷主的虚影说道：“前辈，您一定知道收割协议的秘密。请告诉我，我该怎么做才能阻止这一切？”
药王谷主的虚影沉默片刻，缓缓说道：“收割协议是初代与收割者签订的契约，目的是为了筛选出能够承受宇宙终极力量的容器。洛清瑶从一开始就被选中，她的每一世轮回都是为了完成这个任务。而你，是她最后的考验。”
林夜皱了皱眉头：“最后的考验？这是什么意思？”
药王谷主的虚影解释道：“只有当你和洛清瑶的情感突破收割协议的限制，才能打破这个循环，拯救宇宙。但这并不容易，收割协议的力量非常强大，一旦失败，整个宇宙都将陷入毁灭。”
林夜点了点头：“我明白了。无论多么困难，我都不会放弃。”
说完，林夜集中精神，调动体内的星门能量，与原始洛清瑶展开了一场殊死搏斗。洛清瑶也在一旁协助林夜，她运用自己的力量，试图干扰原始洛清瑶的行动。
在激烈的战斗中，林夜逐渐找到了原始洛清瑶的弱点。他抓住机会，发动了一次致命的攻击。随着一声怒吼，林夜的星门能量击中了原始洛清瑶，原始洛清瑶的身体微微一颤，手中的星砂长矛掉落在地。
“清瑶，醒醒！” 林夜趁机冲上前去，试图唤醒原始洛清瑶的意识。
就在这时，黑盒中的沧溟君意识体突然发出一道光芒。光芒中，沧溟君的声音响起：“林夜，利用我的力量，打破收割协议的束缚。”
林夜心中一动，他伸出手，接住了那道光芒。在光芒的融入下，林夜感受到一股强大的力量在体内涌动。他集中精神，将这股力量与星门能量融合在一起，朝着原始洛清瑶释放出一道强大的能量光束。
能量光束击中原始洛清瑶的瞬间，她的身体开始发生变化。原本冰冷的眼神逐渐恢复清明，脸上也露出了痛苦的表情。“林夜…… 我……” 洛清瑶看着林夜，眼中充满了愧疚和感动。
林夜紧紧地抱住洛清瑶：“清瑶，你终于回来了。”
就在这时，数据雪崩开始逐渐平息，三个星域的退化现象也得到了遏制。林夜、洛清瑶和沧溟君的意识体成功阻止了收割协议的执行，拯救了宇宙。
然而，林夜知道，这只是暂时的胜利。初代和收割者的阴谋或许还没有完全结束，宇宙中依然隐藏着无数的危机。他和洛清瑶、沧溟君决定，继续守护宇宙的和平，迎接未来的挑战……
随着时间的推移，林夜、洛清瑶和沧溟君开始重建被破坏的宇宙。他们利用星棺碎片和生命母树的力量，修复了被数据雪崩摧毁的星球和文明。在这个过程中，他们也对收割协议和初代的阴谋有了更深入的了解。
林夜发现，初代的野心不仅仅是掌控宇宙，他还试图创造一个全新的宇宙秩序，让自己成为宇宙的主宰。而收割协议，就是他实现这个目标的工具。为了彻底摧毁初代的阴谋，林夜和他的伙伴们决定深入调查初代实验室，寻找更多的线索。
在一次探索中，他们发现了初代留下的一份秘密文件。文件中详细记录了收割协议的执行过程，以及初代对宇宙的规划。通过这份文件，林夜得知，初代曾经试图利用星神的力量来实现自己的目标，但最终失败了。为了弥补这个失败，他才制定了收割协议，试图通过筛选容器来获得更强大的力量。
“原来如此，初代的计划比我们想象的还要复杂。” 林夜看着文件，心中暗自思忖。
洛清瑶在一旁说道：“林夜，既然我们已经知道了初代的计划，就必须尽快找到应对的方法。说不定，他还有其他的后手。”
沧溟君的意识体也表示赞同：“没错，我们不能掉以轻心。初代的阴谋可能还在继续。”
就在这时，宇宙中突然传来一股强大的能量波动。林夜等人立刻察觉到了异常，他们迅速朝着能量波动的源头飞去。当他们到达目的地时，发现那里出现了一个巨大的时空裂缝。裂缝中散发着强大的能量气息，仿佛连接着另一个神秘的世界。
“这…… 这是什么地方？” 洛清瑶看着时空裂缝，心中充满了疑惑。
林夜皱了皱眉头：“我也不清楚，但这股能量波动很危险。我们必须小心。”
就在林夜等人准备探索时空裂缝时，一群神秘的生物从裂缝中涌出。这些生物身形巨大，浑身散发着诡异的光芒，它们朝着林夜等人发动了攻击。
林夜等人迅速做出反应，与这些神秘生物展开了激烈的战斗。在战斗中，林夜发现这些神秘生物的力量非常强大，而且它们似乎受到某种力量的操控，对林夜等人展开了疯狂的攻击。
“这些生物到底是什么？为什么会攻击我们？” 洛清瑶一边躲避着攻击，一边问道。
林夜摇了摇头：“我也不知道，但我感觉它们和初代的阴谋有关。我们必须尽快打败它们，进入时空裂缝，找到答案。”
林夜、洛清瑶和沧溟君的意识体相互配合，逐渐占据了上风。在一次激烈的交锋中，林夜发现了神秘生物的弱点。他集中精神，调动体内的星门能量，朝着神秘生物的弱点发动了致命一击。随着一声巨响，神秘生物被击败，倒在地上。
林夜等人继续朝着时空裂缝前进，当他们靠近裂缝时，一股强大的吸力将他们吸入了裂缝之中。在裂缝的另一端，等待他们的将是怎样的挑战和秘密呢……