此时，研究所外围，渡打晕了一个火箭队成员，换上火箭队的制服，混入研究所内。
渡正摸索着往内部走去，他脚步急促，丝毫没有注意到前方的状况，一心只想快点赶到目的地。
而在街道的墙角处，一个少女正悠闲地散步，嘴里叼着一根棒棒糖，腮帮子一鼓一鼓的，粉色的糖纸在微风中轻轻晃动。
就在这一瞬间，渡转过墙角，由于速度太快，根本来不及刹车。“砰” 的一声闷响，他直直地撞上了南云唯（雾枝铃）。
南云唯手中的棒棒糖被这股冲击力震飞出去，在空中划过一道短暂的弧线，随后掉落在地上。
南云唯的身体也因这突如其来的碰撞向后仰去，双手下意识地挥舞着，试图保持平衡。
渡同样被撞得一个踉跄，他稳住身形后，满脸歉意地抬起头，刚想开口道歉，却看到南云唯呆滞的表情。
南云唯坏笑了一下，撅起嘴巴，看着地上沾满灰尘的棒棒糖，嘟囔着：“我的糖……”
渡见状，忙装作路人小兵的样子说道：“实在不好意思，我赔你一根新的棒棒糖。”
南云唯说：“你就是这样和干部说话的嘛！你叫什么，哪个队的！”
“额，那个……”渡表面支支吾吾，手悄悄摸向精灵球。
“算了算了，我就不计较你的错了，各种意义上的，”眼尖的南云唯害怕渡再偷袭自己，挥了挥手，“我正好要去席拉奴博士那里，你把我撞痛了，背着我去！”
“席拉奴……”渡放开捏住精灵球的手：“是！”
渡蹲下身子，南云唯得意地笑了一下，轻轻趴在了渡的背上。
趴在渡的背上，南云唯似乎一下来了精神。
南云唯在渡的背上指挥着：“诶，你到底认不认识路啊，往左边走，那边近些。”
渡回答：“我的方向感不是很好，不是很认得路。”
同时他脚步不停，按照南云唯的指示前行，很快到了控制室。
南云唯趴在渡的背上，在他耳边轻声说：“方向感不好怎么做宝可梦搜查官呢，渡先生？”
“什么？”
还没等渡反应过来，南云唯就跳下渡的背逃走了。
“反正武藏他们在的话说明肯定会失败，现在卖渡一个人情，说不定有一天被捕了还能网开一面呢。”南云唯这么想着。
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雅典娜和席拉奴站在控制室内，看着屏幕，只见武藏等三人穿着潜水装置准备跳进水中。
“接近目标，深度70，停止引擎。”
“现在开始作战。”
“是！”
武藏站在船上，对着小次郎说：“知道了吗，我们的使命是把暴鲤龙引到水面上。”
小次郎问：“可是，为什么不使用精灵球把它抓起来呢？”
喵喵回答：“暴鲤龙是非常重要的实验材料，要抓野生状态的才可以。”
“好久没有身负重任了，我要完美达成任务，向老大强调我们的实力！准备完成，开始行动！”武藏带上呼吸器。
三人跳入水中，很快，一道红白相间的身影破水而出，正是暴鲤龙。它身躯庞大，血红色的竖瞳中燃烧着愤怒的火焰，粗壮的鱼尾用力一拍水面，激起数米高的浪涛。
“趁现在。”雅典娜指挥。
就在暴鲤龙仰天长啸，周身电流滋滋作响时，一张特制的合金网从半空兜头罩下。
暴鲤龙还在挣扎，合金网瞬间爆发出强烈的电流，蓝色的电弧如灵动的蛇般在它体表游走、交织，噼里啪啦地炸响。
尽管暴鲤龙愤怒地扭动身躯，合金网还是在它的剧烈反抗中不断收紧，逐渐压制住暴鲤龙的挣扎。
暴鲤龙的挣扎渐渐变得迟缓，身上的电流也开始减弱，最终，它在一阵不甘的咆哮声中，被合金网紧紧束缚。
“很好，就这样待会研究所。”雅典娜满意地说。
船只拖着暴鲤龙开往实验室，突然一只小锯鳄和蚊香君扒住了网。
“那个小锯鳄和蚊香君是怎么回事？”雅典娜看向岸边，发现带着皮卡丘的少年三人组。
“哼，那就吓吓他们吧，开始照射进化加速电波。”雅典娜指挥。
“方位024，进化加速电波，照射。”
湖边一座高耸入云的神秘电塔散发着冰冷的金属光泽。突然，电塔顶端的核心装置发出一阵剧烈的嗡鸣声，紧接着，一道刺目而诡异的光波从其中喷射而出。
这道光波呈现出深邃的紫蓝色，如同液体般在空气中流动、蔓延。它以电塔为中心，呈环形迅速扩散。
小智肩上的皮卡丘原本灵动的小眼睛瞬间失去了焦距，身体软绵绵地倒在地上，尾巴也无力地垂了下去。
水里的小锯鳄也没能幸免，它在昏迷前努力地挥动着小爪子，随后便 “扑通” 一声栽进了水里。
随着光波的持续扩散，越来越多的宝可梦陷入了昏迷。
辰已悄然靠近，用三个环束缚住了小智等人。
“你们几个居然敢再回来，确实有胆量，不过你们知道了我们太多的秘密，我是不可能放过你们了。”辰已将几人带回研究所。
“你们到底想干嘛？”走在路上，小智质问雅典娜。
“反正你们是无法逃走的，我就稍微告诉你们R计划的内容好了。这是革命性的计划，就是自由控制小精灵进化，这就是我们火箭队伟大的革命性计划！”
“这怎么可能？”
雅典娜指着捕获的暴鲤龙：“这个暴鲤龙就是证明我们开发的进化加速电波成功的铁证。我们利用那个电波照射愤怒之湖，然后，有一只鲤鱼王产生了反应，进化成了暴鲤龙。”
“而且我们还发现这个电波可以当武器使用，不过进化加速电波还没有完成，那个暴鲤龙之所以是红色的，可能是因为鲤鱼王时期的颜色被遗留下来了。我们打算慢慢调查那只暴鲤龙，把进化加速电波做到完善，然后，让宝可梦实现更强的进化，成立最强的宝可梦军团！”雅典娜倒豆子一样把计划全盘托出。
“好了，把他们关起来吧。”雅典娜说累了，让辰已将他们带下去。
“我不会让你们得逞的！”
“你们就尽量叫嚣吧，就凭你们几个想要阻止我们吗，白费力气！哈哈哈……”