这个结果对窦融来说是再好不过了，不但还是做主一方的封疆大吏，而且还远离了自己根深蒂固的河西（今甘肃省中部地区、青海省东部地区及宁夏自治区西北部地区），避免了刘秀对自己的猜忌。
于是窦融欣然应允。
刘秀于宫中设宴宴请窦融，在京俸禄两千石以上的官员受邀参加。
宴会之后，刘秀封窦融为安丰侯，食邑安丰四县（今湖北省黄冈市境内）。
数月后，大司空李通病重，辞去大司空一职安心养病，刘秀又将窦融调回朝中，任大司空，位列三公。
窦融深知，自己虽然有功，可就算没有他的支持，刘秀一样可以统一全国，和那些功勋卓着的战将相比，自己这点功劳算不上什么。再加上他并非刘秀起家时的老臣，这初入庙堂，便封为三公。汉军之中，唯有大司马吴汉和他平起平坐，其他那些功臣官职都在他之下，因此每次上朝都表现的极为谨慎。无论是和刘秀说话，还是和同僚办公，都显得格外的小心翼翼，刘秀对他这个表现十分满意，于是更加亲近他。
刘秀的亲近让窦融更加惶恐，他深怕自己受此恩典，会遭到同僚的记恨，于是上书给刘秀：
臣今年五十三岁，嫡长子年方十五，性格乖张，人品顽劣。臣每次教他经文、武功，从来不让他涉猎星谶、词赋等杂学，就是想让他循规蹈矩的走上正途。可他偏偏不能从善，在河西之时就仗着是臣的儿子到处惹是生非。这样的人在臣死后如何能袭承臣的爵位？若是他在朝中，必定惹得陛下不悦，若是他在封地，那还不作威作福霍乱一方？臣请陛下收回臣的安丰侯，臣死之后，只愿儿子能做个富家翁，就算把家底败光，也不至于惹来杀身之祸。
刘秀看过窦融的奏折后，不允。
下次朝会，会后百官皆退，唯有窦融踌躇不前。
刘秀知道他定是又要来辞官、辞爵，于是令黄门将其打发走。
又一日，刘秀有事单独召见窦融，还没等窦融开口，刘秀便说：“窦周公，朕知道你这么想的，前两天朝会，百官都走了，唯独你留在殿中不肯离去。朕让黄门打法你回去，就是在阐明朕的态度了，今日你见到朕，朕只是一眼，就看出来了，你定是又要说此事。怎么，朕就如此不堪，才让你千方百计的想离朕而去？”
窦融听后，再也没说过辞官、辞爵的话。
经过十多年的连番大战，刘秀不愿意在劳民伤财再行兵事，令中坚大将军杜茂镇守陇西牵制卢芳（今甘肃省东南部地区），并多次派遣使者招降卢芳。
卢芳不愿投降，可杜茂在陇西一边屯田，一边修筑坚固的防御工事，卢芳无论怎么攻打，从什么地方攻打，都不能占到便宜。
后来杜茂帐下副将和当地豪强发生矛盾，副将竟私自带兵灭了豪强满门。
刘秀因杜茂监管不力，将其降职为渔阳太守（今天津市境内），令刘歆接管杜茂兵马。
卢芳得知汉军临阵换帅，趁刘歆立足未稳，尚未完全掌握情况，率军东进，连克彭阳（今宁夏回族自治区固原市境内）、郁郅（今甘肃省庆阳市境内）两城，大有南下侵犯关中之势（今陕西省中部地区）。
刘秀得到消息，一刻未敢停歇，连忙召集邓禹、吴汉、窦融等一干重臣入宫商议。
刘秀说：“这个卢芳，朕本来想着国家已经连年大战，想要休养生息，恢复国力。没想到他竟然如此看不出来个眉眼高低，朕没去找他麻烦，他倒是来找朕的麻烦了。今天朕叫你们来，就是来讨论一下，要不要打？派谁去打？要怎么打？”
吴汉说：“当然要打，这卢芳是个什么狗一样的东西？不但自称天子，还三番五次袭扰我北境。之前咱们打隗嚣的时候，他就蠢蠢欲动，这次竟然还敢攻城略地。陛下，让臣带十万兵马北上，砍了卢芳的狗头，省的他再没完没了的骚扰。”
邓禹说：“大司空，如今国库还有多少存银？还有多少存粮？”
窦融回答说：“目前国库约合黄金一万八千斤，全国各地存粮截至去年年末约有二百万石。”
邓禹问吴汉说：“大司马，十万大军一月要消耗多少粮草？”
吴汉说：“十万大军一月消耗粮食约两万五千石，若加上运粮的民夫，差不多要十五万石。”
邓禹说：“大司马有信心多久灭掉卢芳？”
吴汉说：“卢芳现有兵力不足十万，我不敢说能多久灭掉他，但是三个月之内，准保扫平他城外势力，让他困守城池。”
邓禹说：“如果卢芳向匈奴求援，又当如何？”
吴汉说：“那就调耿征北铁骑前来。”
邓禹问：“重甲铁骑又要消耗多少粮草？”
吴汉说：“如果调集一万重甲铁骑，那人吃马嚼大概一个月一万两千石。”
邓禹说：“那按照大司马的设想，一个月就差不多要消耗二十二三万石粮草。这一仗若是打上一年，还不把国库给打空了？到时候若是再有个天灾，朝廷连赈灾的粮食都拿不出来，岂不要生大乱？再者说，如今我们和匈奴的关系比较微妙，这么多年也并未发生过大的战端，如果把匈奴打毛了，大司马认为以我朝如今的国力，是否能向武帝时期对匈奴进行北伐？”
吴汉思考了片刻后说：“太傅说的对，若论兵力，我们此时远胜武帝时期，可若论财力，的确不支持长期对匈奴开战。”
刘秀听了三人的对话，也从愤怒中冷静了下来，问邓禹说：“仲华，你说，此时我们应该如何？”