创世织机的光芒如银河倒卷般退去，忍界的天空重新显露出澄澈的蔚蓝色。然而，这场终局之战留下的创伤却如同烙印，深深刻在每一寸土地之上。五大国的边境地带，暗物质残留的裂缝仍在缓缓渗出血色雾气，被侵蚀的山脉扭曲成诡异的螺旋状，仿佛时空在此处仍在进行着痛苦的痉挛。那些暗物质裂缝就像宇宙的伤口，不断渗出带着腐蚀性的气息，所到之处，植被迅速枯萎，岩石被染成诡异的灰黑色，就连空气中都弥漫着刺鼻的硫磺味。
纲手瘫坐在医疗部的废墟中，她那只被银色齿轮覆盖的右手已经失去了光泽，齿轮间的翡翠色查克拉也变得黯淡无光。曾经象征着医疗与创造之力的机械义肢，此刻却如同一块冰冷的废铁。医疗班的成员们在残骸中穿梭，抢救着还未完全失效的医疗忍具。瓦砾下散落着破碎的医疗卷轴，被暗物质腐蚀的治疗仪器冒着青烟，一片狼藉。“所有实验体...生命体征全部归零。”一名医疗忍者颤抖着汇报，声音中充满了绝望与无助。纲手沉默良久，从怀中掏出初代火影的细胞样本瓶，瓶中那抹绿色的生命之光在尘埃中微微摇曳，“至少，我们证明了文明火种符文的可能性。”她沙哑的声音中带着一丝疲惫的欣慰。她的眼神中闪过一丝哀伤，随即又坚定起来，深知此刻不是悲伤的时候，他们必须从失败中寻找希望。
妙木山的深潭变成了焦黑的深坑，鸣人跪坐在坑边，九尾查克拉在他周身若隐若现。“那些从虫洞传来的惨叫...”鸣人攥紧拳头，指甲深深掐进掌心，“我能感受到，还有无数个世界仍在受苦。”九喇嘛的意识在他脑海中浮现，巨大的狐影带着前所未有的郑重：“创世织机虽然重启，但混沌残渣并未彻底清除，宇宙的平衡就像风中残烛。”话音未落，鸣人突然抬头，只见天空中闪过一道熟悉的暗物质红光，尽管微弱，却足以让他瞳孔骤缩。那道红光仿佛是黑暗势力的挑衅，勾起了鸣人内心深处的使命感，他暗暗发誓，一定要守护好这个世界，不让更多人遭受苦难。
佐助独自站在龙地洞的壁画前，草薙剑的剑刃仍在散发着余热。壁画上，创世织机的丝线在修复后焕发新生，但原本被混沌侵蚀的角落，隐约出现了新的阴影。“这不可能...”佐助的写轮眼急速转动，试图解析那些异常的纹路，“熵之具象明明已经被彻底消灭。”岩壁突然传来细微的震动，一块新的石板从壁画后方滑落，上面刻着六道仙人最后的预言：“当织机的光芒照亮黑暗，被封印的过往将化作新的危机。”佐助凝视着预言，眼神中充满了警惕与疑惑，他知道，更大的挑战即将来临，而他必须做好准备。
凛在木叶村的高塔上，手持彻底修复的维度之匙。符文表面流转的光芒突然变得紊乱，匙身浮现出细小的裂痕。“怎么会？”她将意识沉入钥匙的核心，却看到无数道因果线正在被某种未知力量拉扯。突然，钥匙爆发出刺目的强光，凛的脑海中闪过一幅幅画面：平行宇宙的边缘，某个被黑暗笼罩的世界里，一只由暗物质凝聚的巨眼正在苏醒。那只巨眼散发着令人心悸的威压，仿佛能看穿一切，吞噬所有生命。凛的身体微微颤抖，她意识到，这个威胁远超他们的想象，而维度之匙可能是他们唯一的突破口。
五大国的紧急会议在摇摇欲坠的云隐村举行。雷影看着全息投影中不断扩大的暗物质污染区域，拳头重重砸在会议桌上：“边境的电磁炮阵列已经失效，暗物质似乎对我们的防御系统产生了抗性。”水影调出一段影像，画面中，雾隐村的忍者正在尝试用新研发的术式净化暗物质，但那些术式接触到暗物质的瞬间就被转化成了腐蚀性液体。“我们需要新的方案。”风影推了推护额，“或许该重新研究初代火影留下的封印术。”会议室里气氛凝重，各国代表们眉头紧锁，不断讨论着应对之策，却始终找不到有效的解决办法。
鸣人、佐助和凛在木叶村的训练场展开特训。鸣人尝试将火之意志与因果之力融合，每次施展出的螺旋丸都会在空气中留下金色的轨迹，但这些轨迹很快就被莫名的力量吞噬。他不断调整查克拉的流动，尝试不同的融合方式，汗水湿透了衣衫，却依然不肯放弃。佐助的须佐能乎在与暗物质模拟体的战斗中，天照火焰竟然开始反噬自身。他咬紧牙关，不断分析战斗中的问题，试图找到控制力量的方法。凛则不断尝试用维度之匙连接其他宇宙，希望能找到对抗新威胁的方法，然而每次连接都会遭遇强大的排斥力，她的鼻腔开始渗出鲜血。但她依然坚持着，用衣袖擦掉血迹，继续专注于手中的维度之匙。
就在众人一筹莫展之际，卡卡西带着大和出现在训练场。卡卡西的写轮眼凝视着天空中的暗物质红光：“我在翻阅千手扉间的古籍时，发现了一种禁忌之术——‘时空回溯封印’。”大和释放出木遁，在地面上生长出巨大的术式纹路：“但这个术式需要消耗整个忍界的查克拉，而且...”他顿了顿，“施法者可能会永远被困在时空夹缝中。”众人听闻，陷入了沉默。这个术式虽然可能是解决危机的关键，但代价实在太大，谁也不知道该如何抉择。
与此同时，暗物质的侵蚀速度陡然加快。砂隐村的沙漠中，无数磁遁傀儡突然失控，开始在地面上挖掘出巨大的坑洞；雾隐村的海域里，海水被染成诡异的紫色，从中浮现出半机械半生物的恐怖怪物；云隐村的天空中，雷电与暗物质交织，形成了能吞噬查克拉的漩涡。五大国的忍者联军再次集结，但这一次，他们面对的不仅是未知的敌人，还有对未来的恐惧。战场上弥漫着紧张的气氛，忍者们握紧手中的武器，眼神中既有恐惧，又有坚定。
鸣人站在联军的最前方，金色的查克拉照亮了所有人的脸庞：“上次我们用信念重启了创世织机，这次，我们要用同样的力量守护新生的宇宙！”他的话语如同火种，点燃了每一位忍者的斗志。佐助的须佐能乎展开双翼，草薙剑直指天空：“无论前方是什么，我们都不会退缩。”凛握紧维度之匙，符文光芒再次亮起：“这次，我一定会找到彻底解决暗物质的方法。”在他们的鼓舞下，联军士气大振，准备迎接即将到来的恶战。
当联军向暗物质核心进发时，鸣人突然感受到一股熟悉的气息。他抬头望向天空，只见混沌核心的残骸中，缓缓浮现出一个半透明的身影——那是熵之具象残留的意识体，它发出尖锐的笑声：“你们以为消灭了我的躯体，就能阻止熵增吗？真正的毁灭...才刚刚开始！”随着它的话语，暗物质疯狂涌动，将整个战场笼罩在一片黑暗之中。而在黑暗的深处，创世织机的丝线再次开始扭曲，新的危机正在悄然酝酿......忍者们在黑暗中严阵以待，他们知道，这将是一场关乎宇宙存亡的战斗，无论多么艰难，他们都不能退缩。