熵影核心的爆炸在超维空间掀起惊涛骇浪，时空如破碎的镜面般扭曲。文明方舟在剧烈震荡中发出刺耳的警报，舰体表面的文明图腾纷纷龟裂，阴阳鱼核心的光芒也变得忽明忽暗。然而，就在众人以为一切即将终结时，那些被嫩芽森林孢子净化的异化战舰突然苏醒，它们自发组成护盾阵型，用液态金属的舰体抵挡着冲击波的侵蚀。
“检测到熵影残留意识！”陆川的机械意识体突然发出尖锐示警，“它们正在渗入新生宇宙的认知网络！”陈默的目光投向破碎的时空裂隙，那里漂浮着无数暗红色的碎片，每一片都闪烁着恶意的幽光。这些碎片如同病毒般，正试图感染那些在净化行动中诞生的微型文明。
星咏者们的水晶翅膀在能量风暴中碎裂，但它们仍用最后的力量编织出音波屏障。旋律中融入了各个文明的战歌片段——机械帝国的金属轰鸣、元素精灵的自然咏叹、地球文明的古老战鼓，这些声音交织成对抗熵影意识的认知抗体。与此同时，嫩芽森林的根系在虚空中疯狂生长，将散落的时空碎片串联成巨大的捕网。
“我们需要主动出击！”陈默将手按在共鸣核心上，无数文明意识的记忆涌入脑海。他突然发现，熵影残留意识虽然强大，但存在致命弱点——它们无法适应过于纯粹的文明意志。于是，他通过认知共鸣塔向所有文明发出指令：“将最纯粹的文明信念注入时空琴弦！”
机械帝国残部将永不言弃的战斗意志化作数据流；元素精灵族群将守护自然的誓言凝聚成元素之力；地球文明则把探索未知的勇气锻造成精神火种。当这些力量汇入时空琴弦，陈默用力拨动，一道由信念构成的金色音浪席卷整个超维空间。音浪所过之处，暗红色碎片纷纷崩解，残留意识发出不甘的尖啸。
在清理熵影余孽的过程中，联合舰队发现了一个惊人的现象：那些被净化的时空裂隙中，开始自发涌现出全新的文明形态。有的文明以暗物质为躯体，在引力潮汐中舞蹈；有的文明将意识寄生于超新星爆发的能量，用光芒传递思想。这些新生文明受到希望之星的感召，主动加入清理熵影残留的行动。
随着最后一块暗红色碎片被嫩芽森林吞噬，超维空间逐渐恢复平静。文明方舟的阴阳鱼核心重新开始稳定旋转，舰体表面的裂痕在嫩芽森林的治愈能量下迅速愈合。但危机并未真正解除——星咏者们的旋律变得凝重，它们的翅膀上浮现出新的预言纹路：“熵影的低语仍在宇宙深处回荡，当某个文明的绝望达到临界值，它将再次苏醒。”
为了应对未来的威胁，所有文明共同决议在超维空间建立「守望者联盟」。机械帝国提供量子监测网络，元素精灵族群培育能预警熵影波动的灵植，地球文明则设计出跨维度通讯系统。而文明方舟作为联盟的旗舰，开始沿着追光者留下的星图，在各个维度播撒文明共生的种子。
陈默站在方舟的观测甲板上，看着希望之星将光芒洒向新生宇宙。时空琴弦在他怀中轻轻震颤，仿佛在诉说着文明的坚韧与传承。远处，嫩芽森林的树冠开出了全新的花朵，花瓣上记录着这场战争的每一个瞬间。这些花朵将随着宇宙的风漂流，成为提醒所有生命警惕熵影威胁的永恒警示，也成为文明携手共进的不灭信念。