“巡天一号”的在轨受挫，如同一盆冰水，浇灭了“太空智算”初期的狂热，也让“渊明系”内部对过于前沿的技术布局产生了一丝疑虑。然而，林渊的战略节奏并未因此被打乱。他深知，科技突破往往遵循“东方不亮西方亮”的规律。就在太空战线遭遇逆风之际，在另一条深耕已久、关乎人类根本福祉的战线上——生物制药，依托“生命智算”平台的努力，终于迎来了石破天惊的“绝地之光”，一次足以改变行业格局的“生物破壁”。
突破点，出现在一个极具挑战性的领域——利用AI加速全新靶点的一类新药研发。传统的药物研发耗时十年、耗资数十亿美金，成功率极低。“渊明”与“药明康德”联合成立的“神农 AI 制药实验室”，将宝押在了一个名为“KARS-01”的全新抗癌靶点上。该靶点由“渊明”的AI平台通过挖掘海量基因组和蛋白质组学数据发现，理论上有望克服现有靶向药的耐药性问题，但其结构和作用机制极其复杂，传统方法难以设计出高亲和力、高选择性的抑制剂分子。
项目前期，团队利用“神农”平台的分子生成AI，产生了数百万个虚拟候选分子，但经过几轮虚拟筛选和初步生化测试，效果均不理想，项目陷入僵局，团队士气低落。
转机源于一次大胆的算法迭代。一位年轻的计算生物学家提出，能否不再局限于小分子抑制剂，而是尝试设计一种基于蛋白降解靶向嵌合体（pRotAc）技术的双功能分子？pRotAc能像“分子胶水”一样，将靶点蛋白与细胞内的蛋白降解系统连接起来，直接清除致病蛋白，理论上可能更高效且不易产生耐药性。但pRotAc分子设计难度极大，好比要用AI设计一个精确的“三体结构”。
团队决定破釜沉舟，将主要资源转向pRotAc路线。他们升级了“神农”平台的算法，使其能够同时优化分子对靶点蛋白和E3泛素连接酶的双重亲和力、连接链的长度与柔性、以及类药性质。海量的计算资源被投入，模拟了数十亿种可能的分子构象。
经过数月不眠不休的攻坚，新算法筛选出的首批pRotAc虚拟分子，在细胞水平实验中展现出了惊人的效果！其中一个代号为“破晓者”的候选分子，在多种耐药癌细胞系中，均表现出高效且特异的靶点蛋白降解能力，且对正常细胞毒性极低！初步的动物模型（小鼠）实验结果显示，其抑瘤效果远超现有标准疗法，并且未观察到明显毒性！
“我们……我们可能真的找到了一个‘明星分子’！” 药明康德的合作方首席科学家在越洋电话中，声音因激动而颤抖。这不仅仅是又一个候选药物，更验证了“AI驱动研发”新模式在攻克最难靶点上的巨大威力！
消息传到林渊耳中，他深吸一口气，强压住心中的波澜。“立刻启动全面的临床前研究！同时，知识产权团队启动全球pct专利布局，要快！要密！”
他指示夏语冰：“准备一份扎实的科研论文，投递给《自然》或《细胞》！我们要用最硬的成果，向世界宣告AI制药时代的到来！”
同时，他命令赵劲松：“启动一轮针对‘渊明生物’的专项融资，估值可以给得高一些，但必须引入顶尖的战略投资人和长期资本，为后续烧钱的临床试验备足弹药！”
绝地之光，生物破壁。“破晓者”的横空出世，不仅为无数癌症患者带来了新的希望，更如同一剂强心针，证明了“渊明系”在“生命智算”战略上巨大投入的价值。它向世界宣告，在征服疾病的道路上，算力与算法正成为与试管和显微镜同样重要的利器。这一次的突破，照亮的是整个生物科技的未来。