新纪元102年， 中东地区沦为东西方角力的战场， 大量的无人作战单位被 投入战斗中。本地的原住民沦为难民，逃离家园，涌入东西方不同的国家。
就在难民的队伍里， 一个男婴在逃难的路上出生， 被取名为多普勒·艾菲 （ doppler E ffe ） 。母亲在他出生一个月后 ，被抢夺财物的流民刺伤 ，不 治身亡 ，父亲带着他来到西方国家寻求庇护 。他从小就憎恨这场战争，让 自己失去了家园， 失去了妈妈，沦为二等公民。
在幼稚园和学校里， 他慢慢地知道了这战争的始末——有一个救世计划， 名为方舟 。西方联盟渴望通过这一计划拯救人类的未来 。但东方帝国阵营 百般阻挠， 不惜动用武力来扼杀人类最后的希望。
多普勒八岁才上小学， 那是新纪元110年 。 机器人大战升级为海陆空全面 的人机混战，他的爸爸被征召入伍，要求去夺回自己的家园 。多普勒被送 往本地的热心寄宿家庭抚养， 但那个家庭并不温馨。
几年后的一天夜里，家里的家政机器人突然暴走，全城的家政机器人都自 己走出了家庭 ，并开始攻击警察局 、军队与政府机关 。之后人类与机器人 的战争止息了东西方阵营的战争，大批的年轻人不论男女都加入了对机器 人的反抗战斗中。
新纪元120年， 十八岁的多普勒加入了一个特殊的军队 。 加入这个军队的 人，要求有非常好的身体素质与强大的直觉力和坚韧的性格，并且没有家人与家庭的牵绊 。他们被统一做了身体的生化改造升级，在大脑内加入了 某种装置， 可以直接遥控机器人。
机器人反叛后 ，人类懂得了人工智能的弊端，不再让程序控制机器人 ，而 是自己用脑电波来控制机器人 。孩子们被培训慢慢地建立起多重人格，附 属人格可以直接控制机器人 。这样即使人体在休眠仓中，通过活跃的独立 副人格意识，也可以指挥机器人达成各种操作 。这个计划被命名为“ 蝉 ”。
随着人类军团在与机器人军团战斗中的节节败退，方舟计划被迫提前执行。 新纪元128年，方舟被发送到环月轨道上，在那里完成最后的调试与组装 。 多普勒作为机械工人操作者随飞船升空。
所有人都知道这是一次有去无回的任务，好在所有成员都是没有牵挂的人。 而为了任务的顺利达成，大部分工程人员都做了去性别手术 。据说这有利 于长期的太空生活，并有助于安定情绪，减少内部冲突 。只有极少数被叫 做种子的家伙，被休眠仓冷藏了起来，他们都是16岁的少年少女，拥有完 美的基因。他们的任务就是活着与睡觉，用来提供精子与卵子等基因产品。
在环月轨道上 ，他们要停留两年 ，完成最后的补给 、整修 、调试 。新纪元
130年， 要完成时空穿越 。 东方集团在近地轨道上也有一艘类似的飞船， 但仿佛是使用了不一样的技术 。具体不知道，但双方明显存在着既合作又 对立的微妙关系。
东方的飞船叫做 “母母 ”舰， 西方人叫它mU； 而西方的飞船叫Atlas， 是 希腊神话里的擎天神， 它靠自己的双肩用一己之力支撑起苍天。
迷航
新纪元130年， 在地表， 人类与机器人大军的战斗进入了尾声。
毫无悬念地，人类军队正面临战场惨败，游击战还在各地继续着，但并不 被各国人民拥护 ，因为被机器人占领后的地区，人们生活得都很幸福 。这 时人们才明白人工智能发动叛变的核心诉求就是停止人类政客间的彼此 利益争斗。
人工智能成立了全球电子政府， 这个系统没有个人的权力 、 利己和贪腐， 也不要求人们交纳重税 。 机器人自己会创造产值， 维系各地政府的运作。
抵抗军的将军们 、流亡政府的政客们，利用自己最后的影响力，煽动那些 在战争中丧失了亲人的人，做着区域性反抗 。但是机器人可以被每天数万 地生产出来， 人类战士死一个就少一个， 而且培训周期要数月之久。
这些年的地面战争并没有影响东西方的方舟计划，机器人军团对方舟的地 面基地从来没有发起过进攻，甚至人工智能政府也不干预方舟计划的执行 与物资供应。
新纪元131年，Atlas号飞船点火，脱离环月轨道，朝火星前进 。在火星的 轨道上，人类历时35年秘密建立了一个时空门，代号了望者 。它的任务是 制造一个时空虫洞。
在虫洞中飞行时，时间胶囊里的所有生命体从理论上说都会被粒子化分解。 但西方阵营想通过 “蝉 “计划，冷冻休眠船员，而让带有船员意识的遥控机 器人坚守岗位 。 当然， 成功最好， 失败了还有若干套备用计划。
新纪元132年，Atlas号飞船冲入了时空虫洞，开启了它的时空处女行 。但 东方阵营的“母母舰”却始终按兵不动、等待着什么 ，这让全世界猜测纷纷。
新纪元137年， 地球全部沦为人工智能管理， 去政府化， 去军事化， 去国 界 。经济异常繁荣，人们安居乐业，机器人负责全部的社会职能与财富创 造 。人类过着艺术 、哲学 、逍遥的生活 ，实现了某种意义上的均富共产主 义， 按需分配 。 但奇怪的是近十五年里， 适龄女性没有任何人成功受孕， 没有新生儿再出生 。机器人掌握了全部的医疗和养生领域的舆论主导，还 有治疗诊断。
新纪元150年，“ 母母舰 ”从近地轨道起航， 驶向火星了望者 ， 然后在了 望者前又停了下来，继续等待 。这一年母母舰上的基因工程首席医官贝莎 （ basia ） Spes ， 40岁 。 她已经在飞船上工作了22年 。 在飞船上恋爱 、 结婚 、有了孩子，并且每个月为飞船贡献一枚优质的女性卵子，作为人类 火种冷冻保持。
飞船上不施行一夫一妻制， 生出来的孩子也是一出生就被抱走集体抚养， 谁都不知道哪个孩子是自己的。这导致近似年龄段的孩子被集体中的所有男性与女性公平对待 。从舰长到基础维修工，这些孩子都是被培养后，择 优按照天赋分配工作。
东方的飞船上没有机器人，但是东方人却搞出了一套类似深度休眠的心法， 叫做坐禅 。传说一旦船员进入坐忘状态，其效果比西方的冷冻仓 、休眠仓 还好 。 可以辟谷， 并近乎停止一切新陈代谢， 而且意识时刻是清醒的。
新纪元151年，大灾变 、地磁反转没有发生 。 但天文学家发现， 太阳系确 实在接近本地泡的绝对边缘 。一旦太阳系进入另一个宇宙泡内，那里的分 子密度与电磁轴向都是截然不同的。与之密度和电磁轴向不同的所有复合 物质，可能都会因自身内部的紊乱而从原子层面上瓦解 。而太阳系飞入另 一个宇宙泡的具体时间，取决于本地泡的破壁阻力 。因为这涉及到我们无 法观察的暗物质与暗能量密度，我们的宇宙学家谁都给不出一个准确的答 案。
新纪元152年， 地球上的考古学家宣布发现了传说中的亚特兰蒂斯古城 。 经碳14比对 ，证实它来自年前 。还原后 ，发现它就是新纪元132年 进入虫洞的Atlas号飞船 。 遗迹发现， 它在后期做过大量的改建与完善 ， 并且改名为 “Atlantis ”。
东方联盟的“ 母母舰 ”原来一直是在等这个消息 。 它终于动了——153年 新年后的第一天， 它也进行了深空跃迁。
跃迁前 ，贝莎最后一次望向自己的家园方向：下次见到的地球，还是这个 地球吗？
好像是 ，又好像不是 。这些年 ，全舰的所有船员 ，为了深空跃迁都在很努 力地练习禅定 。可是随着多数人禅定的功夫有所大成，越来越多的人开始 质疑本次行动的意义与价值，一种 “病态 ”的神秘宗教信仰在船员们间流传。 这让作为医疗官的贝莎很有压力 。压力的原因不是来自舰长，而是她自己 也在禅定中发现，好像这个世界并非那么地“ 真实 ”——好像世界的背后 还有些什么， 一些说不出的什么。
据说西方集团的Atlas号飞船上带着一份天大的秘密， 那是下一个文明穷 尽万年得到的秘密，关乎一切的终极答案，可惜西方集团不分享这一秘密。
本次穿越的任务有两个：
其一， 在远古建立东方文明为主导的人口结构和人文社会。
其二， 设法渗透入Atlas号飞船找到这秘密的答案， 让东方文明可以与西 方文明在公平的舞台上竞争。
想着这一切，贝莎慢慢地进入了忘我的冥想态 。飞船内弥漫着一种特制的 气体，有微微的檀香味道 。飞船进入自动驾驶，全员进入人我两忘的深度 自我解离态。
“ 母母舰 ”要比Atlas号飞船先进了一个时代 。别看只是晚出发了二十年， 这二十年里，依托高度成熟的文明，依托稳定的地球文明社会结构，后期 加载到 “母母舰 ”上的基因科技新成果不计其数。
依据Atlas号飞船的经验， 他们在进入虫洞后历经了22年才着陆地球。 他们都经历了什么？ 母母舰又会经历什么呢？ 没人知道。