在周游关东地区的旅程中，小智一行人途径了静谧的松藻镇，并在那里邂逅了一位在中药店工作的甜美少女清美。
为了实现让她的珍稀药材宝可梦派拉斯进化为派拉斯特的愿望，清美鼓起勇气向小智发出了对战邀请。尽管小智是一位怀揣梦想、坚守原则且具有底线的宝可梦训练家，他却只能忍痛含泪地答应了这场特殊的“比赛”。
“所以情况就是这样，伙伴们，谁觉得自己能输得既优雅又不失风度？”小智召唤出他的所有宝可梦，大家围坐一起召开战术讨论。
“卟呶卟呶～”妙蛙花憨态可掬地表示，老大你懂的，我出手从不分轻重。
“嚯嚯呼～”喷火龙打着哈欠说，老大你也明白，我若出手，对手大概只能收获一捧草木灰烬……
尼多力诺倒是豪情万丈地愿意为小智赴汤蹈火，但他那粗壮的大脚，恐怕会不小心给派拉斯带来更大的困扰……
最后，理想的“陪练”角色落在了皮卡丘、水箭龟以及伊布身上。
“现在，看我的首席大将，金毛萌主皮卡丘出场！”小智用力一挥臂，皮卡丘踮着小脚丫，摇摇摆摆以超可爱的姿态登上了战场……
“加油，派拉斯，全世界期盼救助的人们都期待着你的成长……”清美一边鼓励着自己的派拉斯，一边满心期待。
然而派拉斯皱着眉头，紧张兮兮地走向皮卡丘，双方在擂台上展开了紧张的对峙……
“好嘞～皮卡丘……嗯……”小智此刻显得有些犹豫不决……
“小智，你的思绪飘到哪儿去了？”小霞带着一丝无奈的口吻提醒道。
“没错，小智，派拉斯向你挑战了！”小刚随之附和着喊出声。
只见那小小的派拉斯鼓足勇气，抖动着身上的迷你蘑菇，洒出一片细微的麻痹粉。
小智心中暗自吐槽：你们就不能配合一下，让皮卡丘假装被麻痹粉击中然后晕过去吗？
“皮卡丘，使出……额，算了，就用五伏特攻击吧！”小智尴尬地捂住脸庞。
“皮卡——丘！”皮卡丘机敏地跃起避开麻痹粉，随后竖起一根手指，仿佛在说，比起十万伏特，这一招才更显技巧性……
一道如发丝般细弱的电流直射向派拉斯。
派拉斯瞬间全身一颤，原地转了两圈后，竟然直接晕厥过去。
小智惊讶得难以言表：“这怎么可能！我已经从十伏特下调到五伏特了，居然还是秒倒？这只派拉斯防御力是零吗？”
这时，小刚提出了建议：“小智，要不然试试派出属性上对派拉斯更有优势的水箭龟呢？”
“好吧，就是你了，水箭龟！”小智决定派出第二位选手，“水箭龟，你就当作给蘑菇浇水那样去战斗吧。”
水箭龟：(疑惑脸)卡咪？
“水箭龟是水属性，对战派拉斯有天然优势，一定能行！”清美再次为派拉斯打气。
于是，那只派拉斯尽管微微颤抖，却依然坚定地重新走上战场。
水箭龟沉思了片刻，靠近派拉斯，突然发出一声“呸”，向其喷射出一股水流。
派拉斯再度遭遇冲击，原地旋转两周半后，已然丧失战斗能力。这一幕，甚至让隐身在草丛中的喵喵也不禁发出了叹息，心中暗忖：“这究竟是什么离奇的状况……”
清美只好鼓起勇气，再次恳求道：“派拉斯，你还能再试一次吗？”
于是，她决定派出伊布：“就决定是你了，伊布！”
伊布疑惑回应：“布伊～？”
令人意外的是，伊布并未被派拉斯吓倒，而派拉斯似乎对伊布产生了好感，大胆地凑近去嗅闻。
然而，下一秒——啪！
一个猝不及防的耳光响起，伊布竟出手给了派拉斯一记响亮的巴掌。随后，伊布翻了个白眼，显然对此举颇为无奈。派拉斯则在遭受打击后彻底崩溃，哭着跑开了……
小智望着这一幕，不禁喊了一声：“哎呀，伊布～”只见小家伙迅速跳进他怀里撒娇，这让小智纵有千言万语也无法责备它。
“不好了，派拉斯不见了！”清美从外面跑回来焦急地说。
小智愧疚地揉了揉伊布的小脑袋：“都怪我……”
清美却善解人意地摆摆手：“不，是我请求你和我进行宝可梦对决的。”
小刚适时提出建议：“我们还是分开去找找派拉斯吧。”
小智赞同地点点头：“没错，大家一起行动，去找回派拉斯。”
此刻，独自离家出走的派拉斯偶遇了它生命中至关重要的导师——喵喵……
众人在森林中四处搜寻，发现被火箭队抓走的派拉斯尚未归返。此刻，只能寄希望于喵喵老师能以它的方式，给予派拉斯深切的关注与关怀……
在谈论各类体验时，火箭队拍着胸膛自信满满地声称：“论输的门道，无人能出我们右！”
经过火箭队一番独特调教，派拉斯终于重拾信心，这番转变背后离不开阿伯怪与双弹瓦斯两位小伙伴的“无私奉献”，它们轮番败给派拉斯，为它铺垫了胜利的道路。
找回信心的派拉斯主动回归，并且一开口就向小智发起挑战。鉴于前车之鉴，小智的皮卡丘和水箭龟这次也悟出了“谦让”的真谛，面对派拉斯轻轻一触即倒，佯装疲倦入睡。
于是乎，小智麾下的御三家成员依次上阵，纷纷上演了举手投降的戏码。最终，在喷火龙万分不情愿却又假装战败的努力下，派拉斯成功实现了进化！
“太棒啦，派拉斯进化成派拉斯特了！”在一旁欢呼雀跃的，竟然是火箭队三人组，他们从草丛中欢腾跃出，满心欢喜。
然而，刚刚憋了一肚子气的喷火龙可没那么好说话，立即以一记威力十足的铁尾反击……
“哎呀，真是糟糕的感觉……”伴随着这句话，火箭队三人组无奈退场，而喷火龙则傲娇地喷出一团火焰以示不屑。
“太好了，派拉斯成功进化成了派拉斯特。”清美怀抱着派拉斯特那巨大的蘑菇，脸上洋溢着幸福的笑容。
“没想到啊，小朋友，你的喷火龙等级虽高，却能如此巧妙地配合演戏输掉比赛，可见你对宝可梦训练的理解相当到位呢。”清美的奶奶适时走出，赞赏地对小智夸奖了两句。
自从小火龙时期起，这孩子就一直表现出极高的顺从性，小智满心欢喜地回应道。
在协助清美捕获到派拉斯特之后，小智一行四人也得到了丰富的特效草药作为酬谢。他们挥手告别了静谧的山间小镇，继续踏上了冒险之旅。
值得一提的是，那被火恐龙击败而飞出的火箭队三人，在一番跌跌撞撞后又回到了药店门前。清美以温暖人心的关怀为他们细心包扎伤口。
然而，当喵喵提出想要留在店里充当招财猫时，却被清美的奶奶婉言拒绝了，因为她刚刚在后山捡到了一只猫老大。结果，喵喵再次败给了猫老大，火箭队三人组只好重整旗鼓，重新踏上跟随小智的步伐。
随着与松藻镇渐行渐远，小智四人在小刚的带领下翻山越岭，正艰难穿越着一片沙漠地带。
“小刚，虽然我们是老朋友，但我还是得说，你确定这不是导航故障带我们来的沙漠吗？”小智无力地揶揄着。
“没错，从白天走到黑夜，我们该不会要在沙漠里过夜吧！”小霞亦随之抱怨起来。
尽管疲惫不堪，小刚仍坚定地回答：“我清楚记得，目的地就在附近，肯定有个城市！”
幸运的是，在翻过一座沙丘之后，他们眼前豁然开朗，一座灯火辉煌、昼夜颠倒的城市出现在视野中——那就是霓虹镇，关东地区最负盛名的不夜城，白日休憩夜晚狂欢。
在这一片夜色中，各类夜生活的场景应有尽有，仿佛囊括了所有夜晚应有的风情。若小智他们年长个八九岁，或许就能在此把盏言欢，而此刻，他们只好安分地沉浸在这独特的氛围之中。
“咣当”一声，正当小智一行人漫步其间时，一位身着黑色皮衣、看似混混的青年与小智意外相撞。
“嘿，小子，你撞得我可不轻啊！”这混混顿时满脸不悦。
“搞没搞错？明明是你撞的我，还恶人先告状？”小智揉着手腕，挑衅般扬起鼻尖，眼中闪烁着无畏的光芒。
遵循无限制格斗的第一准则，他决定绝不率先出手，只待对方挥拳过来，便让他见识何为防卫过当。一场对峙就此展开，二人针锋相对，目光交汇如火。
就在这剑拔弩张之际，当地反应敏捷的君莎警官骑着摩托车疾驰而来，迅速将两人分开。
“别吵了，立刻散开！”面对警察的出现，小智虽心有不甘但也只能收回凌厉的目光，而那名混混则冷哼一声，转身离去。
“小伙子们，你们最好尽快找个旅馆休息。这里的居民脾气火爆，由于睡眠不足常常变得焦躁易怒。这种小事能不能别让我再来解释呀？”君莎抱怨了一句后，街角又传来争执声，她旋即驾驭摩托飞速赶往现场处理。
“好吧，我们先去找家旅馆吧。”小智无奈地叹了口气。
相较于小智，火箭队三人组更是霉运连连，他们遭遇的都是性情暴烈的镇民，甫一接触就被按倒在地，紧接着就是一顿暴风骤雨般的拳头洗礼……
若非君莎适时现身并加以阻止，这三位主角恐怕早已变成“猪头”般的存在了……
在这座城市究竟发生了何种神秘事件？而小智三人又将在新的篇章中邂逅哪些未曾谋面的宝可梦呢？
暂且让这一切悬念在梦境中酝酿，待到明日醒来再揭晓答案吧……今夜，晚安……