逃亡到东方的西班牙本土舰队包括陆军海军的不少人都没有太大的资源进行真正意义上如同应天那样的各种测试，因此很多情况下一愕只能“料敌从宽”的来进行安排。加上处于东方贸易节点上的马尼拉并不缺乏长期以来的硝石和硫磺，因此每一艘爆破船上装载的仅仅拥于爆破攻击的黑火药规模就达到了三千磅之多。
猛烈的爆炸即便发生在三丈之外，巨大的气浪和振动也让沉重的船体挂甲猛烈的拍击到了船体之上，带来了不少地方的破损和进水。在巨大的震动之中，绝大多数船员在第一时间就被震昏了过去，只是或许外挂的钢板终究抵御了一些能量的缘故，当整个船体因为破损进水而濒临沉没的时候才终于有一些人反应过来，并早有准备的以极端的方式将身边的人敲醒。
也正是因为在作战之前各主力舰内的官兵们就多少有一定准备，才在面临这样的爆破攻击带来的船只下沉的过程中没有出现船员全体与船只殉葬的事情。
可是当大概一刻钟之后的第二次猛烈而巨大的爆炸发生在距离船体更近一些的距离的时候，被命中的挂甲船就没有那样幸运了。更为巨大的冲击力让挂甲彻底摧毁了船舷，船上的官兵们绝大多数都没有及时的清醒过来，不得不随着下沉的舰只与整个船只一起沉入了水中。
接连两艘主力挂甲船遭受到沉没也让此时的王远清醒过来，迅速下达让船队展开突围的命令，当机动力充分发挥起来之后，虽然大船的航速因为种种原因还是赶不上那些拥有人力车轮装置的小船，可给随后的还击所带来的好处确实不言而喻的。在作战中船上的炮手们也越来也有经验，尽可能的瞄准敌车轮舟的方向以重霰弹展开火力。
接连不断的爆炸声又在随后此起彼伏的响了起来，不过再也没有那令人胆寒的爆炸发生在距离主力船团的挂甲船三四丈以内的距离上。
在遭受了两艘挂甲船和一艘普通船的损失，三艘挂甲船的负伤，人员伤亡损失也达到了三百人之时。进攻中的西班牙与南洋海盗联合准备的夜战突袭攻势也渐渐进入尾声。
不过半个时辰左右的夜战突袭作战中至少有四十艘上下的爆破船被摧毁，百余艘小船不同程度的遭受到了伤亡损失。这些联合舰队进行组织的五千人左右的突击兵力终究不是真正意义上的敢死队，在遭受到了五分之一左右的船只沉没乃至三成以上的伤亡损失之后。那些下定了决心的船长也不得不考虑到生命的价值和意义了。
为了避免同强敌遭遇乃至重蹈之前一些人的覆辙，爆破突击的船队也就在这个时候进攻节奏渐渐的缓慢了下来，黑暗中的目标船也渐渐失去了可以确定的方向。
当天色在小船船队四散搜索中渐渐亮起来的时候，那些东方强敌的船群已经开始位于十余里之外的距离上了。
当然在这个时候借助着夜幕的掩护，西班牙联军主力船团也开始逼近到了临近战场不远的地方再一次的合围了过来。
这一次王远所率领的主力船团没有畏惧与对方交锋，再一次同对手展开了正面的交锋乃至激烈的炮战。
在西班牙海上将领对东方人的看法而言，在经历过这样的挫折和打击之后，敌军的船员往往会开始慌乱起来，这或许可以带来一次胜机。
然而这一次或许是因为感觉到了危机，也或许是因为清晨港湾内没有下午的外海那样大的海浪，王远所率领的主力船团上的官兵们发挥出了更为突出的战斗力，再一次让逼近过来寻求决战的敌船队遭受了不小的损失。
这似乎也就意味着虽然在机动力上的优势并不明显，但海上控制权则明显异手了。在这种情况下，王远毫无顾忌的下令开始针对夜间的敌小船群展开反击。
在风浪相对平静的港湾内，那些能够精确在船舷操作的轻炮在一里左右的距离上也发挥了突出的精度，甚至在两里左右的距离上仍然能够给敌船带来不小的威胁。在那些人力车轮舟四散奔逃的情况下仍然摧毁了二十多艘敌军的小船，更有数十艘敌船被彻底的抛弃了人员不得不拼命的向看起来并不算太远的岸边游去。
大概有八十艘左右的小船最终还是逃过了主力船团的追击和围剿，或者说：这些小船在航速上的优势让不少的人及时的逃离到了岸边之上。
为了最大限度的减轻登陆部队的后顾之忧。船队在以最大速度追击到岸边之后冒着敌船的阻拦也展开了猛烈的霰弹火力杀伤了不少逃亡到岸边的敌军。
只是在经历过这一次交锋之后，或许是因为损失太过严重的缘故，虽然仍然有着航速乃至交战主动权上的优势，西班牙联合舰队却没有再一次主动赶过来求战。
很显然，精良而且穿透力足够的线膛火炮还有那成本不菲的挂甲带给王远所率领的主力船团最大限度的攻防实力，船队也看似渐渐的向远方离去。此时的王远终于可以确信，这一次重要的关口或许真的可以算是渡过去了。
陆上的通信人员送来了有管进攻马尼拉城还算比较顺利的作战报告之后，经过大致的汇总，从第一次海战到登陆作战，再到应付敌联合舰队的突袭乃至驱离敌舰多次作战，整个船队的伤亡损失也达到了接近八百人的规模，其中接近一半是纯损。这也让王远对接下来的行动多少有些犹豫起来。
如果按照常理，或者说可能性最大的一种情况，这个时候的西班牙联合舰队有可能撤退到菲律宾群岛南部的相关要塞，但也有可能向更南端的方向开进，并同巴达维亚的力量汇合。
若说之前这一系列决战自身还能够凭借力量上的优势，似乎显得游刃有余的话，那么如果西班牙联合船队同南方的敌人汇合起来，胜利的把握就毫无疑问的会小了不少。