在云雾缭绕的灵峰山脚下，有一座历史悠久的古寺——灵隐禅寺。这座寺庙香火鼎盛，每日都有众多善男信女前来烧香拜佛，祈求平安吉祥。寺庙周围古木参天，翠竹成荫，宛如一处人间仙境。
然而，近来灵隐禅寺却遭遇了一场前所未有的危机。不知从何处来了一条凶猛的蛇妖，盘踞在寺庙后山的山洞之中。这蛇妖身形巨大，鳞片闪烁着幽冷的光芒，双眼如血红的灯笼，散发着令人胆寒的气息。它时常在夜晚出没，所到之处，树木枯萎，花草凋零，还会发出震耳欲聋的嘶吼声，吓得寺庙里的僧侣和附近的村民们夜不能寐。
蛇妖的肆虐让灵隐禅寺的香火逐渐冷清下来。许多香客因为害怕蛇妖的伤害，不敢再来寺庙进香。寺庙的主持慧明大师心急如焚，他深知若不尽快除掉蛇妖，灵隐禅寺将面临衰败的命运。于是，他召集了寺中的僧众，商议对策。
有的僧人提议请附近的猎户来帮忙捕杀蛇妖，但慧明大师摇了摇头，说：“这蛇妖非同寻常，普通猎户恐怕难以对付，反而会白白送了性命。”又有僧人建议去城里请道士来降妖，慧明大师也觉得不太妥当，他说：“道士虽有法术，但未必能了解这蛇妖的底细，且路途遥远，恐延误时机。”
就在大家一筹莫展的时候，一个衣衫褴褛、疯疯癫癫的和尚来到了灵隐禅寺。他穿着一件满是补丁的破僧袍，脚蹬一双露出脚趾头的草鞋，手里拿着一把破蒲扇，边走边哼着小曲，嘴里还时不时地冒出几句让人摸不着头脑的疯话。这个和尚正是济公。
慧明大师看到济公这副模样，心中虽有些疑虑，但还是热情地接待了他。他向济公讲述了蛇妖作祟的事情，希望济公能想出办法除掉蛇妖，拯救灵隐禅寺。
济公听后，哈哈一笑，说：“主持莫急，贫僧自有办法对付这蛇妖。”慧明大师和众僧听了，都半信半疑，心想这疯和尚能有什么本事。
济公没有理会众人的质疑，他让僧众们准备了一些雄黄、艾草和糯米，又找来一个大鼓和一面铜锣。然后，他带着这些物品来到了寺庙后山蛇妖盘踞的山洞前。
此时，天色已晚，山洞中弥漫着一股阴森的气息。济公深吸一口气，大声喊道：“蛇妖，你出来受死吧！”话音刚落，山洞中传来一阵震耳欲聋的嘶吼声，紧接着，一条巨大的蛇妖从山洞中窜了出来。它张开血盆大口，露出锋利的獠牙，向济公扑了过来。
济公不慌不忙，他迅速将雄黄洒在蛇妖的身上。蛇妖闻到雄黄的气味，顿时身体一颤，发出一声痛苦的嘶吼。但它并没有退缩，反而更加疯狂地向济公发起攻击。
济公一边躲避蛇妖的攻击，一边指挥僧众们敲响大鼓和铜锣。“咚咚咚”“哐哐哐”的声响在山谷中回荡，震得蛇妖头晕目眩。与此同时，济公又将艾草和糯米撒向蛇妖。艾草和糯米散发着刺鼻的气味，让蛇妖更加难受。
蛇妖被济公的攻击激怒了，它使出全身的力气，向济公猛扑过来。济公看准时机，一个闪身躲到了蛇妖的身后，然后迅速踩在蛇妖的背上。他用手中的破蒲扇用力地拍打蛇妖的头部，嘴里还念着咒语。
蛇妖拼命地挣扎着，想要把济公甩下来，但济公就像粘在它身上一样，怎么也甩不掉。经过一番激烈的搏斗，蛇妖渐渐体力不支，它的身体开始抖动起来。
就在这时，济公从腰上解下一个酒葫芦，拔出塞子，将里面的酒洒在蛇妖的身上。酒一接触到蛇妖的身体，立刻燃起了熊熊大火。济公从蛇妖背上跳了开去。而蛇妖发出凄厉的惨叫，在火中痛苦地翻滚着。
不一会儿，蛇妖被大火烧得化为灰烬。济公拍了拍身上的灰尘，笑着说：“这蛇妖已除，灵隐禅寺从此可保平安了。”
慧明大师和众僧看到这一幕，都惊呆了。他们对济公感激不已，纷纷称赞他是活菩萨下凡。从那以后，灵隐禅寺又恢复了往日的热闹景象，香火更加旺盛了。而济公妙除蛇妖护古寺的故事，也在民间流传开来，成为了人们口中惩恶扬善、法力无边的传奇佳话。